英雄无敌5的技能系统是游戏策略深度的核心体现，其设计融合了种族特性与战术多样性。每个种族的英雄拥有专属的种族技能，例如圣堂势力的反击能提升部队反击伤害，森林势力的天敌可针对特定敌人获得属性加成，而地狱势力的异界传送则能召唤援军。这些技能无法跨种族学习，仅能通过装备技能坠饰将专家级提升至终极效果。技能分为基础、高级、专家三级，种族技能额外包含终极等级，但终极效果需依赖特定宝物激活。
公共技能体系包含12类通用能力，如黑暗魔法、防御学、破坏魔法等，每位英雄最多选择5种公共技能与1种种族技能组合。技能升级后解锁对应分支能力，每系最多学习3种能力，需在标准能力与职业特殊能力间取舍。例如防御学系可发展活力无限增强部队生命值，或选择坚守阵地提升抗冲击能力。技能树分支复杂，部分终极能力如骑士的无敌冲锋需满足十余项前置条件，通常需英雄等级达到20级以上才可能实现。
能力分为种族能力与公共能力两类，前者如亡灵巫师的永恒奴役可强化招魂术效果，后者如后勤学的探路术能减少地形移动惩罚。能力一旦习得无法升级，其效果固定且受技能等级限制。英雄升级时技能出现概率与种族相关，例如学院势力英雄更容易获得巫术或启蒙技能选项。技能轮机制隐藏了上下级关系线，玩家需自行记忆或查阅资料才能规划完整成长路径。
实战中技能搭配需考虑英雄定位与战术需求。魔法型英雄优先发展知识属性与魔法技能链，如破坏魔法配合巫术可提升法术暴击率；物理型英雄则侧重进攻术与幸运术的组合，利用暴击加成提高输出效率。经济类技能如资源富饶适合早期发展，而后期战役更依赖战术或战争狂人等战场控场能力。部分能力存在隐性联动，如奥术智慧与魔法学协同可延长增益法术持续时间。
记忆导师是调整技能组合的关键NPC，可付费重置已学能力，但需地图预设该功能。若未规划好技能路线，可能导致英雄满级时无法达成目标build。控制台命令可作为补救措施，但会影响成就获取。技能系统虽自由度高，但部分冷门能力因数值设计缺乏竞争力，玩家需权衡实用性与流派特色。合理利用技能轮机制，能够培养出适应不同战局的专属英雄。
